کتاب «معارف گیاهی» در هشت جلد، حاصل بیش از بیست سال تلاش استاد در زمینه پژوهش و نگارش، مهم ترین اثر دکتر میر حیدر به شمار می رود. جلد نخست این کتاب، به شناخت علمی و خواص درمانی سبزی ها و حبوبات و دانه های خوراکی گیاهی مربوط می شود، در جلد دوم کتاب «معارف گیاهی»، از خواص میوه ها و ادویه جات سخن گفته شده است و جلدهای سوم تا هفتم، به شرح تفصیلی مشخصات، شناخت علمی، خواص درمانی و ترکیبات شیمیایی صدها گیاه دارویی اختصاص دارد. جلد هشتم این کتاب نیز شامل فهرست های گوناگون در خصوص گیاهان مختلف است.