کتاب الطهاره اولین اثری است که امام خمینی (س) به تفصیل درباره مسائل فقهی به نگارش درآورده اند. این اثر، که تدوین آن از سال 1373 ق آغاز و در سال 1377ق به پایان رسیده است، برحسب ترتیب موضوعات کتاب شرائع الاسلام ـ محقق حلی ـ که در میان فقها به «قرآن فقه» شهرت دارد ـ سامان یافته است.
کتاب الطهاره علاوه بر این که خود گواهی بر تتبعات گسترده فقهی و حدیثی امام خمینی(س) به شمار می آید، به ذکر اقوال، و نقد و بررسی آنها پرداخته و در برگیرنده مباحث رجالی و اصولی مفیدی است که مراجعه کننده را با انبوهی از داده ها و تحلیل های فقهی، حدیثی و اصولی مواجه می نماید.
مباحث «حیض»، «استحاضه»، «نفاس»، «تیمم» و «نجاسات» مقاصد و محورهای عمده این اثر چهار جلدی به شمار می روند.