عالم ربانی حضرت آیت الله حاج سید حسین یعقوبی قائنی قدس سره به اصرار شاگردان، به بیان بخشی از زندگی نامه و خاطرات خویش پرداختند و در ضمن آن، بسیاری از نکات مهم سلوکی را تبیین نمودند و در اختیار سالکان راه خدا قرار دادند. این مجموعه، هم اکنون با نام «سفینة الصادقین» منتشر شده و در دسترس علاقه مندان قرار گرفته است. این اثر به زبان عربی نیز ترجمه شده است.
استاد معظم در ابتدای این کتاب می فرمایند: «درخواست مکرر جمعی از برادران ایمانی مبنی بر آشنا شدن با نحوه سیر و سلوک حقیر و کمّ و کیف آن، بنده را بر آن داشت تا شمه ای از یافته های خود را در ضمن قضایای متعدده و جریاناتی که در طول زندگی برایم پیش آمده، در جلسات معنوی و محافل انس برای آنان بازگو نمایم. مجموعه حاضر که به نام سفینة الصادقین نامیده شده، انعکاس صحیح و کامل آن گفته ها است که توسط چند تن از دوستان تنظیم گردیده و بارها با دقت و تأمل مورد مطالعه این جانب قرار گرفته و تنها نسخه ای است که مورد تأیید می باشد. امیدوارم مؤمنین و سالکین راه حق از آن بهره مند گردند».
بخشی از عناوین این کتاب عبارت است از: توحید عرفا، معرفت نفس، نقش ربط در راه سلوک، تأثیر اعمال بر نفس و لزوم پایبندی به شرع مقدس.
گزیده کتاب
بلی، درد فراق دردی است سوزان که آتش آن به مراتب از آتش مادی سوزنده تر است. هر قدر شناخت و معرفت و درنتیجه محبت نسبت به محبوب بیشتر باشد، آتش فراق آن سوزنده تر خواهد بود. تا جایی که مولا امیرالمومنین علیه السلام در مقام راز و نیاز عرض می کنند: فهبنی یا الهی و سیدی و مولای و ربی صبرت علی عذابک، فکیف اصبر علی فراقک. پس ای عزیز! چرا در خود دردی احساس نمی کنی؟ و چرا هیچ مشابهتی به موالیان خود نداری؟ آنان چه چیز درک کرده اند که لحظه ای به دنیای فانی دل نبسته و بی تابانه در انتظار لحظه دیدار دوست ایستاده اند؟ دمی بیندیش و بنگر تا چه حد از حال آن بزرگواران فاصله داری و از آنان که خانواده کرامت و باب رحمت خداوندی اند استمداد کن.