یکی از گرانبها ترین کتب صدرالمتألهین، تفسیری است که وی بر کلام الهی نگاشته که در یک مجموعه هشت جلدی گردآوری شده است. جلد چهارم از این مجموعه نفیس به آیه 38 سوره بقره تا آیه 65 از این سوره اختصاص یافته است.
صدرالمتألهین ذیل آیه چهل و پنجم سوره بقره: (ولقد علمتم الذین اعتدوا منکم فی السبتِ فقلنا لَهُم کونوا قردهً خاسئین) در باب معنا و مفهوم تناسخ و دلایل آن بحث نموده و سپس مراد آیه را تبیین و تشریح نموده است. همچنین ایشان ذیل آیه چهل و هشتم این سوره: (واتّقوا یوماً لاتجزی نفسٌ عن نفسٍ شیئاًَ ولا یُقبَلُ مِنها شفاعه ولایوخَذُ مِنها عَدلٌ ولاهم ینصرون) از معنی و اسرار شفاعت به طور مستوفی سخن گفته است.
همچنین برای سهولت در امر تحقیق در پایان کتاب مجموعه کاملی از فهرست ها (احادیث، اشعار، نام اشخاص، مکانها و اصطلاحات) آمده است.