کتاب «آزادی و آزاداندیشی» دارای مقدمه ای است مشتمل بر مبانی آزادی و آزاد اندیشی در اسلام، موانع و محدودیتهای آن و سپس در هفت فصل مطالب کتاب تنظیم و ارائه گردیده است.
فصل اول: منظومه فکری اسلام در باب آزادی و تفاوتهای آن با ریشه و منشاء آزادی در غرب مورد بررسی قرار گرفته است. فصل دوم: در خصوص شروع بحث آزادی در غرب بعد از رنسانس و کمبودها و خلأهای آن و درباره آزادی از چهار منظر بحث شده است. فصل سوم: آزادی هدیه اسلام و انقلاب اسلامی فصل چهارم: نهضت آزاد فکری و کرسیهای آزاد اندیشی و آداب آن. فصل پنجم: حدود آزادی و سوء استفاده مطبوعات از آزادی. فصل ششم: تضادهای رفتاری غرب با شعار آزادی. فصل هفتم: آزادی و حقوق زنان در اسلام و غرب مورد بررسی قرار گرفته اند.