در نظام جمهوری اسلامی ایران که بر پایه ی نظریه ی ولایت فقیه ساماندهی یافته، این سئوال مطرح است که نسبت میان نظریه ی ولایت فقیه و نظریه ی تفکیک قوا چیست؟ و با توجه به این که هردو نظریه در قانون اساسی جمهوری اسلامی ایران پذیرفته شده، آیا بین آن ها سازگاری وجود دارد؟ با فرض وجود این سئوال و اختلاف دیدگاه ها در نظریه ی ولایت فقیه، هدف عمده ی پژوهش حاضر، پاسخ گویی به پرسش از ماهیت و جایگاه تفکیک قوا در نظریه ی ولایت فقیه است. بر این اساس در فصل های متعدد این پژوهش بر این نکته تاکید شده که تنها در صورتی می توان از نسبت میان ولایت فقیه و نظریه ی تفکیک قوا گفت و گو کرد که مفهوم متخذ از ولایت فقیه به معنای تعطیلی عقول نخبگان و سلب انتخاب گری از مردم، به ویژه دخالت در کار قوا و نهادها نباشد. عناوین مختلف کتاب، بدین قرار است: "ولایت مطلقه ی فقیه: دیدگاه وتفسیرها"، "تفکیک قوا: مفهوم، مبانی و بسترها"، "منزلت تفکیک قوا در نظریه ی ولایت فقیه" و "مناسبات ولی فقیه با قوا و نهادهای حکومتی".